2001
I.A.48. As lógicas da cidade: o impacto sobre a fé e sob o impacto da fé. São Paulo: Loyola, 2001. 229 p. (Theologica, 2).
I.A.49. Crer num mundo de muitas crenças e pouca libertação. São Paulo: Paulinas; Valencia: Siquem, 2001. 156 p. (Livros básicos de teologia, 1). (2.ed. 2010).
I.A.50. A arte de formar-se. São Paulo: Loyola, 2001. 127 p. (CES, 10). (4.ed. 2004; 6.ed. 2012).
I.A.51. Introdução à vida intelectual. São Paulo: Loyola, 2001. 298 p. (3.ed. 2006; 4.ed. 2012).
2002
I.A.52. A religião no início do milênio. São Paulo: Loyola, 2002. 283 p.(2.ed 2011).
2003
I.A.53. Olhando para o futuro: prospectivas teológicas e pastorais do cristianismo na América Latina. São Paulo: Loyola, 2003. 251 p. (Theologica, 9).
2004
I.A.54. Um outro olhar: coletânea de homilias de J. B. Libanio. Belo Horizonte: Marta M. Aguiar, Patrícia F. Del-Faro e Maria A. Fonseca, 2004. v.1, 131 p.
I.A.55. Gustavo Gutiérrez. São Paulo: Loyola, 2004. 79 p.
I.A.56. Jovens em tempo de pós-modernidade: considerações socioculturais e pastorais. São Paulo: Loyola, 2004. 245 p. (Humanística, 9).
I.A.57. Qual o caminho entre o crer e o amar? São Paulo: Paulus, 2004. 110 p. (Questões fundamentais da fé, 4). (2.ed. 2005).
I.A.58. Fé. Rio de Janeiro: Jorge Zahar, 2004. 75 p. (Passo-a-passo, 34).
2005
I.A.59. Concílio Vaticano II: em busca de uma primeira compreensão. São Paulo: Loyola, 2005. 223 p. (Theologica, 14).
I.A.60. Um outro olhar: coletânea de homilias de J. B. Libanio. Belo Horizonte: BIG, 2005. v.2, 154 p.
I.A.61. Como saborear a celebração eucarística? São Paulo: Paulus, 2005. 120 p. (Questões fundamentais da fé, 7). (4.ed. 2008).
2006
I.A.62. Um outro olhar : coletânea de homilias de J. B. Libanio. Belo Horizonte: BIG, 2006. v.3, 164 p.
I.A.63. Um outro olhar: coletânea de homilias de J. B. Libanio Belo Horizonte: BIG, 2006. v.4, 176 p.
I.A.64. Qual o futuro do cristianismo? São Paulo: Paulus, 2006, 158 p. (Temas da atualidade). (2.ed. 2008).
2007
I.A.65. Conferências Gerais do Episcopado Latino-Americano: do Rio de Janeiro aAparecida. São Paulo: Paulus, 2007. 167 p.
I.A.66. Um outro olhar: coletânea de homilias de J. B. Libanio. Belo Horizonte: BIG, 2007. v.5, 140 p.
I.A.67. Os carismas na Igreja do terceiro milênio: discernimento, desafios e práxis. São Paulo: Loyola, 2007. 285 p.
I.A.68. Creio em Deus Pai. São Paulo: Paulus, 2007. 60 p. (Reimpressão 2008,2012)
I.A.69. Creio em Jesus Cristo. São Paulo: Paulus, 2007. 61 p. (Reimpressão 2008, 2013)
I.A.70. Creio no Espírito Santo. São Paulo: Paulus, 2007. 61 p. (Reimpressão 2008, 2013)
2008
I.A.71. Em busca de lucidez: o fiel da balança. São Paulo: Loyola, 2008. 370 p.
I.A.72. Juventude: seu tempo é agora. São Paulo: Ave Maria, 2008. 116 p.
I.A.73. Um outro olhar: coletânea de homilias de J. B. Libanio. Belo Horizonte: BIG, [2008]. v.6, 168 p.
2009
I.A.74. Caminhos de existência. São Paulo: Paulus, 2009. 188 p. (Reimpressão 2012).
2010
I.A.75. A escola da liberdade: subsídios para meditar. São Paulo: Loyola, 2010. 446 p.
I.A.76. Ecologia: vida ou morte? São Paulo: Paulus, 2010. 78 p.
I.A.77. Um outro olhar: coletânea de homilias de J. B. Libanio. Belo Horizonte: BIG, 2010. v.7, 196 p.
